我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

作者: 责任编辑:庞博 来源: 新华社 更新时间:2020年02月09日 点击数:

新华社北京2月1日电(记者 魏梦佳)北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显著提升。

核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。目前,RNA测序技术已广泛应用于绘制物种转录组图谱、研究疾病分子调控机制等方向。据了解,针对不同研究需求,不同起始量的RNA需采用不同的RNA扩增方法,但目前常见的扩增方法大多操作繁复、耗时长。对于微量样本的检测,也存在很多技术挑战。

研究人员发现,被广泛应用于DNA测序建库技术的Tn5转座酶可以直接作用于RNA/DNA杂交链,从而省去传统RNA建库技术中的扩增等必不可少但繁琐的操作步骤,同时也避免了预扩增过程中所带来的偏向性。这种新的基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库方法,被命名为“SHERRY”。

据作为课题组成员的北京大学黄岩谊教授和清华大学王建斌研究员介绍,实验结果表明,SHERRY建库质量较好,对碱基序列表现出了较高的均衡率,且操作流程简单,整个流程仅需要5个步骤,可在一个试管中完成,时间仅约4小时,其中手工操作时间不到半小时,大大节省了实验成本。

课题组专家、北京大学生物医学前沿创新中心主任谢晓亮教授表示,新方法应用广泛,首个临床应用是对新型冠状病毒感染者的样本进行测序。与现有的RNA测序建库方法相比,“SHERRY”更灵敏、更简单,这对检测和分析十分重要。

“我们的团队目前正在夜以继日、争分夺秒地攻关,希望提供更好的新型冠状病毒的测序方法,服务疫情防控需要。”谢晓亮说。