医学生物学研究所研究进展快报【第18期】
孙强明团队绘制猴痘病毒感染中m⁶A表观转录组动态图谱
2026年7月,中国医学科学院医学生物学研究所孙强明团队在《Cell Communication and Signaling》发表题为“Coordinated Reprogramming of the m⁶A Epitranscriptomic Machinery During MPXV Infection”的研究论文。该研究通过时间序列转录组与m⁶A甲基化组整合分析,描绘了猴痘病毒(MPXV)感染恒河猴外周血中宿主m⁶A修饰的动态变化特征,为理解MPXV感染相关的表观转录调控提供了基础数据。
猴痘病毒的全球流行凸显了深入认识宿主-病原相互作用的必要性。目前MPXV感染的转录组响应已有报道,但表观转录调控层面,尤其是N⁶-甲基腺苷(m⁶A)修饰是否参与其中尚不清楚。针对这一问题,研究团队采集MPXV感染后第7、14、21天的恒河猴全血样本,开展了时间序列的转录组与m⁶A甲基化组测序。结果显示,MPXV感染伴随免疫通路抑制和代谢过程激活,同时全基因组m⁶A修饰水平呈现升高趋势,并观察到甲基转移酶METTL3表达上调、去甲基化酶(FTO、ALKBH5)及阅读蛋白(YTHDF1-3)表达下调。在Huh7细胞中敲低METTL3或YTHDF2可降低病毒复制水平,提示这些调控因子可能参与病毒复制过程。
图1. 猴痘病毒感染过程中m⁶A表观转录调控机器的协同重编程
团队整合分析共鉴定出38个在三个感染时间点均存在转录与m⁶A修饰协同变化的基因。结合文献报道的MPXV相关致病通路,进一步筛选出11个在转录和修饰层面均发生改变的宿主基因。其中,DNAJB1是两种筛选策略交集所得的单一基因,可作为后续功能研究的候选关注对象。m⁶A修饰位点分布分析显示,转录起始位点附近及5′UTR区的修饰与基因表达呈正相关,而编码区修饰则呈弱负相关。免疫细胞特征评分显示,T细胞、NK细胞及单核/巨噬细胞特征逐渐下降,B细胞特征呈上升趋势。跨数据集比较表明,不同组织来源及病毒株的公共数据中可观察到部分一致的m⁶A调控趋势。
图2. 多组学交叉分析鉴定猴痘病毒感染中受m⁶A调控的靶标及生物标志物
本研究通过系统描述MPXV感染过程中宿主m⁶A修饰及其调控组分的动态变化,并提供若干潜在受m⁶A调控的候选基因,为后续针对表观转录调控在病毒感染中作用的功能验证研究提供了线索和依据。
本项工作得到国家新发突发和重大传染病防控国家科技重大专项(2025ZD01900500、2025ZD01900505)、云南省基础研究专项重大项目(202401BC070008)、云南省云岭学者人才项目(YNWR-YLXZ-2019-008)、云南省科技重大专项(202402AA310021)、中国医学科学院医学与健康科技创新工程(2021-I2M-1-036、2021-I2M-1-024)以及云南省高层次人才培养计划(L-2019030)的支持。
原文链接:https://link.springer.com/article/10.1186/s12964-026-03090-w

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